为了确保矿山工程甲级监理公司在项目中识别和管理风险和危险源，可以采取以下措施：
1. **制定风险和危险源管理计划：** 在项目开始之前，矿山工程甲级监理公司应制定详细的风险和危险源管理计划。制定计划时，需要考虑到项目中潜在的风险和危险源，分析其可能出现的影响和后果，并确定相应的防控措施。
2. **风险和危险源识别：** 矿山工程甲级监理公司要通过风险和危险源识别程序，全面梳理项目可能出现的风险和危险源。该过程需要考虑项目所处的环境、人员、设备、法律法规等因素。
3. **风险和危险源评估：** 在识别出潜在的风险和危险源后，矿山工程甲级监理公司需要对其进行评估，以确定其发生概率和可能的影响和后果。评估结果有助于决策者在防范风险时更全面、科学地评估其可能的影响和后果，并采取相应的防范措施。
4. **危险源排查：** 在项目实施过程中，矿山工程甲级监理公司需要定期排查潜在的危险源，并对其进行识别和分析。排查的过程中可以采用现场观察、检查记录、调查评估等方法。
5. **风险和危险源控制和管理：** 对于潜在风险和危险源，矿山工程甲级监理公司需要采取控制和管理措施，使其对项目的影响降到最低。这些措施包括：
- 风险和危险源控制计划，包括防范措施和应急响应措施。
- 设备维修和保养细则，包括日常安全检查和维护标准等。
- 域内风险和危险源报告，以支持良好的危险源管理和更好的工作环境。
6. **监督和检查：** 监督和检查是确保控制措施有效的关键。矿山工程甲级监理公司需要设定一个监督和检查计划，来确保控制措施的发挥作用，并及时发现和纠正异常和问题。
通过上述措施，矿山工程甲级监理公司能够更好地识别和管理项目中的风险和危险源，并减小其对项目安全和稳定运行的可能影响。
